Hoy mismo, me preguntaba un amigo por el jabber, como iniciar de manera automática Gnome Shell pues siempre que reinician el escritorio que se muestra por defecto es Unity y tienen que seleccionar manualmente Gnome-Shell desde LighDM.

El comando a ejecutar es:

sudo /usr/lib/lightdm/lightdm-set-defaults -s gnome-shell

Y si queremos que se vuelva a usar por defecto Unity:

sudo /usr/lib/lightdm/lightdm-set-defaults -s ubuntu

Gracias a Ubuntu Life por el tip.